Что за болезнь на алоэ? И как с ней бороться?

Как выглядит ваш алоэ? Какие признаки заболевания? Вы ни написали, ни фотографию не вставили. Если возможно, то вставьте фотографию.

Думаю, что ваш алоэ поражен бактериальной инфекций  (бактериалка).
Такие пятна могут появиться при резком изменении температуры окружающей среды и, как правило, отмечаются в межсезонье. В летний период их возникновение тоже бывает, это связано с резким перепадом температуры и  наличием сквозняка (при постоянно мокром коме земли в горшке) или  из-за обильного полива, что приводит к  переувлажнению.
Обратите на условия содержания алоэ, при необходимости измените их, и отрегулируйте режим полива. Кроме этого, обычно рекомендуется удалить поврежденные участки, что конечно испортит вид самого растения,  а во время полива обработать растение  фунгицидом.