Как сделать современный ремонт в доме, который обшит вагонкой и оштукатурен глиной?

Утеплять, конечно, лучше всего снаружи. Тогда точка росы зимой будет в худшем случае в утеплителе, а не в основном стеновом материале. А у вас это дерево, на сколько я понимаю.
Изнутри проще всего утеплить и шумоизолировать минеральной ватой. Весьма экологичный материал — базальт. А закрыть изнутри всё это гипсокартоном. Тоже весьма экологично. Ни смол, ни клея.

Всем добрый день!
Каркас у вас есть, и, по всей видимости, прочный. Он послужит скелетом, на который следует одеть современные тепло и звукоизоляционные материалы. Демонтируйте наружную обшивку, причем, если она вам нравится, сохраните для последующего восстановления ее на старом месте после ремонта. На внешнюю часть стен требуется установить теплоизоляционные плиты толщиной 100 мм, например, УРСА, Роквул или Технониколь. Лучше устанавливать плиты 50-ти миллиметровой толщины в два слоя, в разбежку, со сдвигом между слоями, чтобы не было проходных щелей.
Поверх плит укладывайте…. Тут есть два варианта.
1- штукатурку, которую затем нужно покрасить.
2-й вариант – направляющие рейки, на которые монтируете сайдинг или вашу уже испытанную вагонку. Причем, не забудьте, между плитами и обшивкой проложить гидроизолирующую мембрану, например Tyvek или Delta. Она сохранит теплоизоляцию от наружного увлажнения. Чтобы сберечь теплоизоляцию от паров влаги, неизбежно присутствующей в человеческом жилье, внутреннюю поверхность стен обшейте пароизоляционным материалом, например, односторонне фольгированным Пенофолом производства компании «Лит» из Переславль-Залесского, причем — фольгой – внутрь помещения. По фольге «пустите» направляющие рейки, по которым закрепите гипсокартонные щиты, например, KNAUF. Вот и весь порядок сооружения современного тепло-звукоизоляционного щита для частного дома, причем из экологически чистых материалов.
Попутно, эти материалы заметно улучшат акустический комфорт в вашем доме, стоящим, рядом с проезжей частью дороги.
Не скрою, шум в большей части проникает в человеческое жилище через окна. Поэтому, имеет смысл подумать об установке звукоизоляционных пакетов, по крайней мере на той стене, которая выходит непосредственно на дорогу. А раз мы сказали о звукоизолирующих окнах, это значит, что придется устанавливать, какую-никакую, хотя бы самую простенькую, систему принудительной вентиляции. То есть — как минимум, ставить вентилятор.
Все, что я тут написал является более широким раскрытием всех необходимых позиций, о которых совершенно справедливо и технически грамотно написал вчера Андрей К.