Что делать, если при пересадке повредилась верхняя почка у магнолии?

Пока ничего не делать. Весной у вашей магнолии крупноцветковой (Magnolia grandiflora 'Little Gem') пойдет развиваться побег из нижней почки, которая сейчас не активна. Она и не может быть активной, т.к. на календаре осень, и даже вечнозеленые растения вступают в фазу относительного покоя, видимого роста в этот период не предвидится. Я так поняла, что вы собираетесь ее выращивать в кадочной культуре. Поэтому вам надо будет в мае-июне 2022 года подкормить ее (после полива), лучше прикопать прямо с горшком в саду, чтобы не было перегрева корневой системы и поливать. Зимовать она должна у вас в светлом месте с низкими положительными температурами в пределах +5+8 град С, полив сокращен.