Треснул ствол молодой черешни. Что делать?

Наиболее правильным будет попытка срастить трещину.
Кстати, трещина продольная? Отрыв боковой ветви? Излом на перегибе?
Лучше конечно фотографию прикрепить, для точного диагноза и лечения.
В любом случае садовый вар только предохранит от попадания насекомых, спор грибных болезней и бактерий. Но он же будет препятствовать нарастанию каллюса и зарастанию раны.
Наиболее правильное решение — периодическое обмазывание раны болтушкой из глины и коровяка с добавлением хлорокиси меди или медного купороса. При этом раза 2 — 3 за сезон надо очищать рану от замазки и обновлять до зеленого края. Такое периодическое раздражение вызывает нарастание каллюса и постепенное затягивание раны.
Если на ране появляется камедетечение, то это место также следует очистить до живого и натереть листьями щавеля. В сложных случаях, когда полностью зачистить рану невозможно можно использовать раствор нитрафена. Это очень сильный фумигатор и сильно ядовитый конечно, но на мертвой древесине хорошо выжигает всю заразу, а в живую практически не проникает.