Помогите разобраться, что с рассадой петунии?

Удобрение такое. В садовых центрах поспрашивайте препарат «ферровит» или его аналоги.

Ирина, слабая корневая система может быть от того, что растюхам тесно. У петуний хороший «аппетит», и корни у них довольно мощные, разветвленные. Я уже не первую весну наблюдаю, как они меняются буквально на глазах после пересадки в емкость побольше. Боюсь, что Вашим просто голодно, не хватает питания.
Ну и плюс — избыток тепла. Им тепло и светло — они расти хотят, а для роста недостаточно силенок. Я бы рассадила их в емкости побольше (по крайней мере, отсадила бы для начала самые крупные растюхи) и переставила туда, где прохладнее, как Вам уже посоветовали.
Покажу свою рассаду. Она у меня сейчас сидит по 2 штучки в емкостях 0,5 л. Когда буду высаживать, весь земляной ком будет оплетен корнями, проверено. «Живет» рассада в парнике уже две недели. На улице ночью и минус бывает, в последние дни снег лежал, но в парнике ниже нуля не опускается, и вот как петуньки себя чувствуют:



 Часть из них — ампельные, они тянутся вверх. А те, что кустовые, — компактные и приземистые, начинают ветвиться. 

Рассаду баловать не надо. А то избалуете, потом высадите на клумбу, а она от обалдения или сразу помрёт, или здорово перебаливать будет. Чем более спартанские условия у рассады, тем ей потом лучше.