Чем заболела рассада перцев?

Похоже, нужно просто подсыпать землицы… Я бы на всякий случай обработала фитоспорином.

Белые пятна похожи на зачатки корней, но я не уверена, с перцами у меня мало опыта. У томатов я бы зуб дала, что корни полезли.
А вот потемнение напоминает кое-кого другого — чёрную ножку, бич и чуму рассады. Заболевание неизлечимо, если кустик заболел — немедленно следует его уничтожить. Протекает болезнь следующим образом: сперва низ стебля темнеет, растение отстаёт в росте и развитии, начинает вять, потом ближе к земле как бы образуется перетяжка, и в итоге кустик подламывается и падает. Чёрная ножка — грибковое заболевание, вызываемое довольно большим количеством разных гнилей. Для её развития необходимы следующие неблагоприятные факторы: высокая влажность, холод, скученность растений (а следовательно, темнота и отсутствие свободного притока воздуха между кустиками). Если симптомы совпадают с описанием, обязательно уничтожьте без всякой жалости всю рассаду с малейшими симптомами — её уже не спасти. Остальные кустики присыпьте песком, если он есть (если нет, то перлитом, самым мелким керамзитом, только не землёй — возбудитель живёт в любом грунте!), подсушите в стаканчиках грунт и расставьте растюхи на максимально возможное расстояние, чтобы они друг друга не затеняли. И на недельку обойдитесь только самым необходимым поливом, только чтобы не увяли.