Привитая ветка яблони забивает родные. Спилить?

Не выровняются. Это и не требуется. На плодоношение то, какая часть кроны больше, выше и разветвленнее — не влияет. Говоря, что ситуация нормализуется — имелось же ввиду, что подвой начнет вновь плодоносить. Да и привой тоже. Обычно, когда хорошо идет вегетация — плодов меньше, мало или вовсе нет (особенно на деревьях молодых, как в вашем случае). Нечему там еще плодоносить особо, ветвей обрастающих не так много, плодушек тоже, горизонтально ориентированных ветвей тоже (молодые побеги не в счет). То, что это поросль от пня и поросль именно культурного сорта — повезло. По сути, не особо важно, сколько лет корням — важно, сколько лет надземной части. Если спилить сорокалетний орех — его пяти-семилетняя поросль плодоносить не будет. Плодоношение наступает позже. «Подбодрить» подвой можно кербовкой на вертикально ориентированных побегах, но без обрезки привоя это будет малоэффективно. Проведите обрезку привоя на перевод на внешние боковые ответвления, срезав примерно половину всего прироста за всё время его роста, а все ветви (как подвоя, так и привоя), идущие в центр кроны — обрежьте полностью. Таким образом вы сформируете классическую чашеобразную крону и внешне деревце будет «равномерным», без «перекосов». Точнее, его верхняя часть. Потому что в целом крона сама по себе неравномерная, имеются боковые ответвления, что делает её однобокой (хотя это можно легко исправить, срезав «вылезающую» в сторону нижнюю ветвь (на фото слева внизу)). Все срезы на любых деревьях при обрезке делаются, не оставляя даже полусантиметровых пеньков.